Am 14.04.1959 stand auf LC-​18 A in Cape Canaveral endlich die nächste Vanguard Rakete bereit. Befördert werden sollte bei dieser Mission ein „großer“ Vanguard Satellit, dessen Hauptinstrument ein Protonenmagnetometer darstellte. Mit diesem sollte untersucht werden, ob der vorhergesagte „Stormer-Chapman–Ring“ um die Erde existierte. Außerdem war geplant, einen aluminiumbedampften aufblasbaren Ballonsatelliten auszusetzen. Dieser 76 cm Ballon sollte Aufschlüsse zur Dichte der oberen Atmosphäre liefern. Doch dann führte eine Abweichung beim Treibstoffdruck der Zweitstufe, zu einer Verzögerung von ganzen 0,3 s bei der Trennung von der ausgebrannten Erststufe. Das reichte, um die Oberstufen ins Taumeln zu versetzen und die Kreiselsteuerung zu überlasten. Acht Minuten nach dem Start stürzte die SLV-​5  nach einigen 100 km Flug vor der Küste von Cape Canaveral ins Meer.