Rechtzeitig vor der Ankunft des ersten bemannten Sojus-​Raumschiffs machte der Progress M1-​3  Transporter am 01.11.2000 um 04:05 UTC den Kopplungsstutzen am „Swjesda“ Moduls der Internationalen Raumstation frei. Rund zwanzig Stunden zuvor hatte in Baikonur die Sojus-​U 11A511U abgehoben, die die erste permanente Besatzung zur neuen Raumstation befördern sollte. Die Progress leitete um 07:05 UTC das Retromanöver ein und wurde damit gezielt in die unteren Schichten der Atmosphäre gesteuert. Wie die Berechnungen zeigten, zerbrach das Raumschiff erwartungsgemäß und verglühte am 01.11.2000 gegen 07:53 UTC über dem Südpazifik. Am nächsten Tag nahmen William Shepherd, Sergej Krikaljow und Juri Gidsenko die ISS in Betrieb.